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केंद्रीय आयुर्वेद अनुसंधान संस्थान की स्थापना 21 जून 1971 को केरल के त्रिशूर जिले के चेरुतुरुत्ति में हुई थी। वर्षों से, संस्थान ने बुनियादी सुविधाओं और अनुसंधान गतिविधियों के मामले में अभूतपूर्व प्रगति देखी है। हालांकि संस्थान वर्षों तक मुख्य रूप से एक केंद्रीय अनुसंधान संस्थान के रूप में जाना जाता था, लेकिन स्वास्थ्य सेवा और अनुसंधान में और अधिक उन्नति के लिए जून 2017 में इसे पंचकर्म के लिए राष्ट्रीय आयुर्वेद अनुसंधान संस्थान का दर्जा दिया गया। अस्पताल आधारित सेवाओं के माध्यम से सार्वजनिक स्वास्थ्य सेवा की जरूरतों को पूरा करने के अलावा, संस्थान आयुर्वेदिक विज्ञान के विभिन्न क्षेत्रों में अनुसंधान के लिए भी समर्पित है। संस्थान को तंत्रिका-मांसपेशी और मांसपेशी-कंकाल विकारों पर विशेष जोर देते हुए पंचकर्म प्रक्रियाओं के मानकीकरण और प्रमाणीकरण पर ध्यान केंद्रित करने का दायित्व सौंपा गया है।
यह संस्थान 5.94 एकड़ भूमि पर बना है और विभिन्न ब्लॉकों में फैला हुआ है। संस्थान में एक सुस्थापित प्रशासनिक ब्लॉक और एक सात मंजिला पूर्ण विकसित अस्पताल ब्लॉक है, जिसमें आउट पेशेंट, इन पेशेंट, पंचकर्म, अनुशास्त्र, पैथोलॉजी और बायोकेमिस्ट्री विभाग कार्यरत हैं। यहाँ 60 बिस्तरों वाला इन पेशेंट विभाग है, जिसे पुरुष सामान्य वार्ड, महिला सामान्य वार्ड, पे वार्ड और सुइट रूम में विभाजित किया गया है। संस्थान के अस्पताल अनुभाग में 2008 से मरीजों की देखभाल के लिए एक्स-रे और ईसीजी इकाइयाँ भी उपलब्ध हैं। संस्थान में एक फार्माकोलॉजी विंग भी है, जिसमें एक सुस्थापित पशुशाला और जीएमपी प्रमाणित फार्मेसी है, जिसमें पूर्ण रूप से सुसज्जित गुणवत्ता नियंत्रण प्रयोगशाला है।
संस्थान भारत और विश्वभर के मेडिकल स्नातकों को 'पंचकर्म चिकित्सा में प्रमाण पत्र पाठ्यक्रम' (सीसीपीटी) नामक प्रशिक्षण कार्यक्रम के माध्यम से पंचकर्म में व्यावहारिक प्रशिक्षण प्रदान करता है। अब तक लगभग 600 डॉक्टरों ने पंचकर्म में प्रमाण पत्र पाठ्यक्रम पूरा कर लिया है। इसके अलावा, संस्थान स्वास्थ्य क्षेत्र कौशल परिषद (एचएसएससी)-राष्ट्रीय कौशल विकास निगम (एनएसडीसी) से संबद्ध 'पंचकर्म तकनीशियन पाठ्यक्रम' भी चला रहा है, जो पंचकर्म चिकित्सक के पद के इच्छुक स्नातकों के लिए एक वर्षीय व्यावहारिक प्रशिक्षण पाठ्यक्रम है। संस्थान ने 2021 में 'मर्मा चिकित्सा में प्रमाण पत्र पाठ्यक्रम' (सीसीएमसी) भी शुरू किया है। संस्थान केरल भर के बीएएमएस छात्रों के लिए इंटर्नशिप प्रशिक्षण कार्यक्रम भी चला रहा है, जिससे लगभग 2000 छात्रों को लाभ हुआ है।
संस्थान में एक बहु-विशेषज्ञता वाला बाह्य रोगी विभाग (ओपीडी) संचालित होता है। स्थापना से लेकर जनवरी 2026 तक संस्थान द्वारा प्रदान की गई ओपीडी सेवाओं से लगभग 28,34,571 रोगियों को लाभ प्राप्त हुआ है। संस्थान ने ओपीडी स्तर पर पंजीकरण, परामर्श और प्रभावी दस्तावेज़ीकरण के लिए आयुष अस्पताल प्रबंधन सूचना प्रणाली (एएचएमआईएस) लागू की है। संस्थान अंतर्रोग्य रोगी देखभाल प्रदान करने के लिए भी समर्पित है। अंतर्रोग्य विभाग में अब तक लगभग 20,000 रोगियों को भर्ती किया गया है और उनका इलाज किया गया है। संस्थान में औसतन 95% बेड भरे रहते हैं।
जैव रसायन एवं विकृति विज्ञान विभाग आईपीडी मामलों, ओपीडी मामलों और विभिन्न अनुसंधान परियोजनाओं में नामांकित अनुसंधान विषयों की संपूर्ण प्रयोगशाला जांच कर रहा है और पूर्व-नैदानिक अध्ययन और नैदानिक परीक्षणों के माध्यम से आयुर्वेदिक दवाओं/सूत्रों की सुरक्षा और प्रभावकारिता पर अनुसंधान कर रहा है।
संस्थान में जीएमपी प्रमाणित फार्मेसी है जो ओपीडी/आईपीडी सेवाओं के साथ-साथ अनुसंधान उद्देश्यों के लिए भी दवाएं तैयार करती है। फार्मेसी में निर्मित अनुसंधान दवाएं सीसीआरएएस के अन्य सहायक संस्थानों को भी आपूर्ति की जाती हैं। संस्थान में एक गुणवत्ता नियंत्रण प्रयोगशाला भी है।
संस्थान में एक सुस्थापित फार्माकोलॉजी प्रयोगशाला है जिसमें प्रीक्लिनिकल अध्ययन करने के लिए सीपीसीएसईए पंजीकृत प्रायोगिक पशुशाला की सुविधा उपलब्ध है।
संस्थान के पुस्तकालय अनुभाग में हिंदी और अंग्रेजी में 3500 पुस्तकें हैं।
आयुर्वेद मोबाइल हेल्थकेयर प्रोग्राम (एससीएसपी के अंतर्गत एएमसीआरपीपी), जिसे भारत सरकार के आयुष मंत्रालय के सीसीआरएएस द्वारा विकसित किया गया है, को संस्थान द्वारा वर्ष 2015 में संस्थान के आसपास के क्षेत्र में अनुसूचित जाति की आबादी के स्वास्थ्य स्तर में सुधार लाने के उद्देश्य से शुरू किया गया था।
संस्थान एकलव्य मॉडल आवासीय विद्यालयों (ईएमआरएस) के विद्यार्थियों के लिए सामान्य स्वास्थ्य जांच परियोजना भी चला रहा है, जिसमें चुनिंदा रोगों (तपेदिक, एनीमिया, सिकल सेल रोग और कुपोषण) पर विशेष ध्यान दिया जाता है और एनीमिया एवं कुपोषण के आयुर्वेदिक प्रबंधन पर भी जोर दिया जाता है। संस्थान ने प्रजनन एवं बाल स्वास्थ्य देखभाल कार्यक्रम (आरसीएच) और स्वास्थ्य संरक्षण कार्यक्रम (एसआरपी) जैसी अन्य आउटरीच गतिविधियां भी चलाई हैं।
आयुर्वेद साहित्य में योगदान देने वाले इस संस्थान ने विभिन्न राष्ट्रीय और अंतर्राष्ट्रीय पत्रिकाओं और अन्य प्रकाशनों में लगभग 500 शोध लेख प्रकाशित किए हैं, जिनमें मर्म चिकित्सा पर स्मारिका, शोध प्रकाशनों का संकलन आदि शामिल हैं।
संस्थान को विभिन्न गतिविधियों के लिए पुरस्कार प्राप्त हुए हैं, जिनमें त्रिशूर के टोलिक से उत्कृष्ट प्रदर्शन, बाढ़ पुनर्वास के लिए किए गए उत्कृष्ट प्रयासों के लिए आयुर्वेद मेडिकल एसोसिएशन ऑफ इंडिया से सम्मान प्रमाण पत्र, आरोग्य एक्सपो 2002, औषध केरलम 2013 जैसे कार्यक्रमों में सक्रिय भागीदारी आदि शामिल हैं।
संस्थान की स्थापना से लेकर आज तक इसके अधिकारियों को आयुर्वेद विज्ञान में उनके योगदान के लिए राष्ट्रीय और अंतरराष्ट्रीय स्तर पर मान्यता प्राप्त हुई है।
संस्थान ने राष्ट्रीय और अंतर्राष्ट्रीय स्तर पर विभिन्न विषयों पर लगभग 300 सेमिनार और कार्यशालाओं का आयोजन किया है। संस्थान ने 'आयुष फॉर इम्युनिटी' जैसे कई जागरूकता अभियान, राष्ट्रीय और अंतर्राष्ट्रीय दिवसों के अवसर पर आम जनता के लिए जागरूकता कक्षाएं, छात्रों के लिए जागरूकता कक्षाएं आदि भी आयोजित की हैं।